O acervo documental do Museu da Educação iniciou-se a partir da década de 1990 e, ainda, continua em processo de crescimento. Sua abrangência decorre das pesquisas:

1. Educação Básica Pública do Distrito Federal (1956-1964): origem de um projeto inovador;
2. Educação Básica Pública do Distrito Federal (1964-1971): desmonte de um projeto inovador;
3. Projeto de Extensão Contínua "Memória da Educação do Distrito Federal";
4. Projeto de Extensão Contínua "Museu da Educação do Distrito Federal", e em outras realizadas sobre temas inerentes à educação.

Integram, ainda, o acervo do Museu da Educação as entrevistas do Programa de História Oral, gravadas em áudio e em áudio e vídeo com professores, gestores, pesquisadores, pioneiros, estudantes do sistema de educação pública do Distrito Federal, comunidades e personalidades de Brasília, cujas ações se relacionam com as áreas de trabalho do Museu, além de artigos, monografias, dissertações, teses, livros, fotografias, vídeos, entre outros.

Esse acervo, na sua totalidade, abrange produção material e imaterial, situada em dado contexto e tempo histórico, consubstanciando-se em valioso patrimônio educativo que contribui para reconstituir a história e preservar a memória da educação pública do Distrito Federal, de modo a permitir a análise dos fundamentos, das políticas e dos acontecimentos que caracterizaram a sua origem e o seu desenvolvimento.